للفلفل الحار العديد من الفوائد الصحية خاصة فيما يتعلق بالتخلص من الدهون والوزن الزائد، كما أن إضافة الفلفل الحار تكسب الطعام نكهة وطعمًا غنيًا. وأثبتت الأبحاث والدراسات الحديثة أن للفلفل الأحمر الحار العديد من الفوائد الصحية لصحة الإنسان، حيث إنه يعد البديل الأمثل للملح، حيث يسهم في تحسين مذاق الطعام دون أن ترفع مستويات الصوديوم بالدم، لذلك فهي لا تتسبب في رفع مستويات ضغط الدم.
يسهم الفلفل الأحمر في الحد من الحساسية وإزالة احتقان الأنف عند الإصابة بالبرد والإنفلونزا، كما أن لها القدرة على التخلص من المخاط وتصريفه، السيطرة على الوزن حسب العديد من الأبحاث، حيث تسهم في تنشيط التمثيل الغذائي للجسم ومنع تراكم الدهون.
ويسهم ايضاً الفلفل الأحمر في منع انتشار سرطان البروستاتا لدى الرجال وذلك بسبب احتوائها على مادة الكابسايسين "capsaicin" التي تسهم في السيطرة على الوزن، كما أن الفلفل الأحمر يعمل على تقوية المناعة والتخفيف من فرص الإصابة بالأمراض، كما يسهم في قتل البكتيريا الضارة ومنع فرص الإصابة بقرحة المعدة، مفيد لمرضى السكري، حيث يمنع ارتفاع مستويات هرمون الأنسولين في الدم.